Geber86 / Getty Images
Viktige takeaways
- Children's Hospital Los Angeles gjennomførte den største pediatriske genomiske COVID-19-undersøkelsen til nå.
- Studien rapporterer om en mulig sammenheng mellom visse SARS-CoV-2 mutasjoner og sykdoms alvorlighetsgrad.
- Prøver viste høye nivåer av genetisk variasjon i California.
Som mange virus gjennomgår SARS-CoV-2, viruset som forårsaker COVID-19, mange genetiske mutasjoner ettersom det sprer seg over en stor befolkning. Forskere begynner bare å forstå disse variasjonene og deres innvirkning på helseresultatene, spesielt hos barn.
I den største pediatriske genomiske COVID-19-studien til nå fant et team fra Children's Hospital i Los Angeles en sammenheng mellom virale mutasjoner og alvorlighetsgraden av sykdommen. November-studien ble publisert i tidsskriftetÅpent forum smittsomme sykdommer.
"Hvis vi kan gjøre noe for å finne ut om det er noen sammenheng mellom genetikken til virusgenomasjonen og sykdomsfenotypen (de observerbare egenskapene til COVID-19), kan du bli informert om hvordan man best kan behandle pasienten," Xiaowu Gai , PhD, en av studiens forfattere og direktør for bioinformatikk ved Children's Hospital Los Angeles, forteller Verywell.
I et forsøk på å bedre forstå hvordan genetisk variasjon kan påvirke en pediatrisk populasjon, analyserte forskerteamet den genetiske informasjonen om viruset fra 141 infiserte barn mellom 13. mars og 16. juni. Disse prøvene viste et høyt variasjonsnivå og utbredelsen av en vanlig mutasjon som er assosiert med høyere overføringshastigheter.
Hva dette betyr for deg
Det genetiske materialet til SARS-CoV-2, viruset som forårsaker COVID-19, utvikler seg kontinuerlig. Forskere jobber for å forstå hvordan genetiske mutasjoner kan påvirke virusets overføring og alvorlighetsgraden av sykdommen for infiserte pasienter.
Et stadig skiftende virus
Mutasjoner er feil som oppstår i virusets genom - eller genetisk materiale - når det replikeres. De fleste virus opplever en viss variasjon når de sirkulerer en populasjon. I SARS-CoV-2 er mange av mutasjonene ubetydelige eller kan til og med svekke viruset. Andre kan imidlertid påvirke hvor lett viruset overføres og til og med hvor alvorlig sykdommen er.
“Når mange mennesker tenker på COVID-19, tenker de på denne ene tingen, denne singulariteten," sier Gai. "Men det er ikke slik vi ser på det. Viruset i en hvilken som helst pasients kropp med en virusinfeksjon er en blanding av mange forskjellige kopier av dette viruset. "
En vanlig mutasjon, kalt D614G, forårsaker endringer i virusets piggprotein, selv om det ikke var utbredt da viruset begynte å spre seg over hele verden tidligere i år, har versjonen siden blitt dominerende over hele verden. Forfatterne rapporterer at det var til stede i 99,3% av barneprøvene de samlet inn.
D614G-mutasjonen, som øker piggproteinet som brukes av viruset for å få tilgang til humane celler, lar viruset overføre lettere. Det er foreløpig ingen avgjørende bevis for at denne mutasjonen endrer alvorlighetsgraden av sykdomssymptomer.
COVID-19 piggproteinet medierer koronavirusinngang i vertscellen.
Forskergruppen fant imidlertid en sammenheng mellom clade 20C - en mutert versjon av viruset - og mer alvorlige symptomer. Kladene 20A, 20B og 20C er alle nylig muterte versjoner av viruset. Alle de alvorlige pediatriske tilfellene og alt annet enn ett moderat alvorlig tilfelle i denne studien hadde en versjon av viruset med clade 20C.
Implikasjoner av mutasjoner
"Når publikum ser på en uttalelse som dette, høres det skummelt ut at viruset muterer," sier Stuart Campbell Ray, MD, smittsom ekspert og professor i medisin ved Johns Hopkins University, til Verywell. “Men alle RNA-virus har en mutasjonsrate. Og mutasjonsraten til SARS-CoV-2 er omtrent fem ganger tregere enn influensa - i det minste har den vært til dags dato. "
Denne relativt langsomme mutasjonshastigheten kan være nyttig for forskere som prøver å få tak i det nye viruset. Imidlertid advarer Ray om at når populasjonen av smittede mennesker øker, vil også mutasjonen skje.
Med introduksjonen av løsninger som støtter immunforsvaret mot virusinfeksjonen - som vaksinering, tidligere eksponering for viruset, rekonvalesent plasma og antistoffbehandling - kan SARS-CoV-2 utvikle seg for å unngå immunrespons. Dette betyr at det er mulig at vaksinekandidater som for tiden er lovende, kan bli mindre effektive de neste månedene ettersom viruset fortsetter å mutere.
"Det er en risiko - fordi denne pandemien er ute av kontroll - at disse mutasjonene kan akkumuleres, og akkurat de rette kan skje som kan unngå immunresponser," sier Ray, som ikke er tilknyttet studien.
Vaksiner som har vist seg å være effektive, vil likevel sannsynligvis beskytte kroppen mot viruset. Men som det er tilfelle med andre utbredte virus som influensa, kan det være nødvendig med tilleggsversjoner eller nye versjoner av vaksinen for å dekke eventuelle nye stammer av viruset som dukker opp i fremtiden.
Å håndtere ukjente variabler
Selv om COVID-19 ofte rapporteres å være mindre alvorlig for barn enn voksne, blir ett av tre barn innlagt på grunn av sykdommen innlagt på ICU, ifølge studien. Gai sier at for de pasientene som opplever et alvorlig forløp av å forstå virusets genetiske sammensetning kan gi noe viktig innsikt for utviklingen av behandlingen.
Likevel kan sminke av selve viruset bare fortelle genetikere så mye om hvordan det vil påvirke mennesker som er smittet. De må også vurdere demografien og den genetiske informasjonen til den smittede personen.
Gai advarer om at selv om disse funnene kan antyde en sammenheng mellom visse mutasjoner og deres resultater, er det fortsatt behov for mange større studier for å vise at en mutasjon definitivt forårsaker mer alvorlig sykdom. Til tross for å være den største genomiske pediatriske COVID-19-undersøkelsen hittil, inkluderte den bare 141 barn.
"Det er faktisk ikke veldig stor utvalgsstørrelse," sier Gai. "Vi kan umulig gjøre korrelasjonsanalysen for hver enkelt mutasjon med en sykdomsfenotype."
I tillegg tok studien ikke hensyn til forskjeller i alder, kjønn, eksisterende forhold og andre viktige faktorer. Funn relatert til virusmengden til pasienter kan også være skjevt basert på når prøver ble samlet inn fra pasientene. Likevel bidrar studien til en økende mengde kunnskap om hvordan genetisk variasjon kan forme viktige helseresultater.
"Vi trenger rapporter som dette for å få en følelse av hvordan viruset utvikler seg," sier Ray. "Sekvenser fra studier som dette, når de er satt sammen med sekvenser fra hele verden, har stor betydning for å hjelpe oss å forstå hvordan dette viruset utvikler seg, og om vi trenger å justere strategiene for å håndtere det."
.jpg)
.jpg)
